Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms