Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms