Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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