Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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