Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms