Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms