Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms