Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbx1P41778 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbx1P41778 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms