Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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