Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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