Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Timp3P39876 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Timp3P39876 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Timp3P39876 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Timp3P39876 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Timp3P39876 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Timp3P39876 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Timp3P39876 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms