Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig1P37913 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lig1P37913 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms