Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms