Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TpoP35419 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TpoP35419 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TpoP35419 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TpoP35419 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TpoP35419 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TpoP35419 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TpoP35419 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TpoP35419 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TpoP35419 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TpoP35419 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TpoP35419 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TpoP35419 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TpoP35419 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TpoP35419 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TpoP35419 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TpoP35419 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TpoP35419 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TpoP35419 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms