Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn11P35235 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn11P35235 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms