Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Saa4P31532 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Saa4P31532 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms