Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa10P31310 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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