Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms