Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccnd3P30282 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd3P30282 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms