Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VtnP29788 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VtnP29788 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VtnP29788 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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