Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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