Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RxrbP28704 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RxrbP28704 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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