Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb3P28231 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms