Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Psmb9P28076 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms