Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vav1P27870 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Vav1P27870 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vav1P27870 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vav1P27870 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms