Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms