Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb7P26011 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb7P26011 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms