Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc6P23475 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xrcc6P23475 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xrcc6P23475 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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