Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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SftpcP21841 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SftpcP21841 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SftpcP21841 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms