Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3P21107 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms