Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VimP20152 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VimP20152 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VimP20152 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VimP20152 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VimP20152 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VimP20152 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
VimP20152 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
VimP20152 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VimP20152 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VimP20152 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VimP20152 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VimP20152 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VimP20152 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VimP20152 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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