Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a1P19437 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms