Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18533 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18533 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18533 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18533 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18533 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18533 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms