Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18524 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18524 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18524 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P18524 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18524 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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