Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtpraP18052 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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