Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxb1P17919 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxb1P17919 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms