Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf271P15620 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf271P15620 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms