Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim30aP15533 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms