Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb1P13372 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms