Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DmdP11531 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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DmdP11531 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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DmdP11531 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
DmdP11531 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
DmdP11531 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DmdP11531 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DmdP11531 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DmdP11531 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DmdP11531 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DmdP11531 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DmdP11531 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DmdP11531 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DmdP11531 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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DmdP11531 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DmdP11531 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DmdP11531 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DmdP11531 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DmdP11531 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DmdP11531 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DmdP11531 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DmdP11531 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DmdP11531 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DmdP11531 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DmdP11531 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DmdP11531 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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DmdP11531 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DmdP11531 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DmdP11531 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms