Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms