Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Prf1P10820 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prf1P10820 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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