Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hoxc6P10629 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hoxc6P10629 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hoxc6P10629 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hoxc6P10629 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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