Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tmem254aP0DN89 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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