Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb8P09632 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb8P09632 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms