Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TtrP07309 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TtrP07309 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms