Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P04213 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P04213 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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P04213 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P04213 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P04213 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P04213 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P04213 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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