Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01837 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01837 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01837 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01837 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01837 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01837 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01837 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01837 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01837 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01837 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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P01837 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01837 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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