Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01648 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01648 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01648 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01648 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01648 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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