Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01644 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01644 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01644 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01644 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms